あまり流行ってない感がありますが、リモートデスクトップで接続した先のアプリのウィンドウだけ表示するRemoteAppという機能がWindowsファミリーにあります。
通常は会社等でシン・クライアントやセキュリティ対策、アプリケーションの互換性対策として、リモートデスクトップサービス（RDS）を導入した上で使われるものですが、実はサーバOSでなくてもリモートデスクトップ機能を持つ Windows Vista/7 Ultimate／Enterprise、Windows 8.1/10 Pro/Enterprise であればRemoteAppでアプリケーションのホストとして動作します。
RemoteAppを有効化するには、アプリケーションホストとなるWindows側でリモートデスクトップを有効化した上で下記のレジストリを変更します。
キー：HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE\Microsoft\Windows NT\CurrentVersion\Terminal Server\TsAppAllowList
値の名前：fDisableAllowList
値の種類：REG_DWORD
値のデータ：1
接続する側はテキストエディタ等で以下のようにRDPファイルを作成します。
full address:s:接続先ホスト名orIPアドレス remoteapplicationmode:i:1 remoteapplicationprogram:s:"起動するアプリケーションのフルパス" remoteapplicationname:s:"アプリケーション名（任意の名前）" remoteapplicationcmdline:s:"コマンドライン引数（任意）"
このRDPファイルを使って接続すると、指定したアプリケーションがリモート先で起動しウィンドウだけがクライアント側に表示されます。